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晶能生物技术(上海)有限公司

高通量测序技术服务、基因芯片技术服务、数据分析服务、分子生物学服务

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上海晶能生物:基因芯片技术服务
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招商区域: 上海
有效期至: 长期有效
最后更新: 2014-08-21 17:11
详细信息

上海晶能生物:基因芯片技术服务

1. 基因组层次服务:

Illumina全基因组分型芯片采用Infinium技术,该技术无需PCR反应,不依赖限制性内切酶,在SNP位点的选择上可以完全根据基因组情况来选择,芯片反应通过等位基因特异性延伸来完成,保证了高质量的实验数据。SNP是迄今为止分布最为广泛、存在数量最多的一种遗传多态性。SNP的研究将帮助我们寻找新的遗传病的致病基因或易感基因,认识人种、人群、个体间的遗传差异,疾病与个体差异的关系,以及个体差异对药物的耐药性存在的不同的反应能力。

芯片名称: Human omni-1 quad beadchip
芯片信息: Human omni-1 quad 芯片数据来自于人类千人基因组计划测序结果。其中包含了超过114 万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行4 个样本的检测。该款芯片包含针对基因SNPs,标签SNPs,拷贝数变化(CNV), 及其他高价值的基因组区基因组区域域设计探针。

芯片名称:Human omniexpress-12 beachip
芯片信息:含盖人类基因组计划HapMap三个阶段研究的数据,针对基因SNPs,标签SNPs,拷贝数变化(CNV),及其他高价值的基因组区域设计探针.共700,000多个位点,每张芯片可同时检测12个样本。在r2 > 0.8 前提下,在CEU,JPT+CHB,YRI等人种中基因组覆盖率分别为:0.91,0.91,0.68。CNV区域平均间隔4.0kb。

芯片名称:Human omni-zhonghua-8 beachip
芯片信息:此芯片是一款专为中国人设计的全基因组SNP基因分型芯片,每张芯片做8个样品,芯片覆盖了在中国人群体中发现的常有和稀有变异,适用于全基因组关联研究(GWAS)。经优化的90万个标签SNP信息来自HapMap所有三个阶段及千人基因组计划(1kGP)。并经策略性选择,可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。

芯片名称:Infinium HumanExome BeadChip
芯片信息:Human Exome BeadChip芯片前所未有地覆盖了推定的功能性外显子变异,这些变异精选自12,000多个个体的外显子组和全基因组序列。外显子内容包含了> 240,000个标志物,它们代表了不同群体—包括欧洲、非洲、中国和西班牙个体—以及多种常见病,如II型糖尿病、癌症、代谢及精神疾病。

芯片名称:CytoSNP-12 BeadChip
芯片信息:CytoSNP-12 BeadChip 芯片,包含30万个和疾病相关的遗传标。数据来源于Hapmap  I和II。芯片名称:Omni2.5-Quad BeadChip
芯片信息:Omni2.5-Quad BeadChip芯片,包含250万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔1.2kb,MAF>2.5% 。数据来源于Hapmap  I到III和  1000 Genomes。

芯片名称:Omni5-Quad BeadChip
芯片信息:Omni5-Quad BeadChip芯片,包含500万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔0.6kb,MAF>1% 。数据来源于Hapmap  I到III和  1000 Genomes。

Illumina 其它物种SNP芯片服务



2. MRNA表达谱芯片服务

(1) Illumina全基因组表达谱芯片

Illumina针对人、小鼠的完整RNA样本开发了全基因组表达谱芯片产品(采用直接杂交的方法), Illumina全基因组表达谱微珠芯片使得在更高通量水平上的生物学研究成为可能,可以广泛地应用于高置信度靶位点发掘,疾病分子分型和分子通路分析等研究领域上。研究人员现在可以在一张芯片上获取多个样本的全基因组表达谱。

芯片品牌:美国Illumina

芯片名称:HumanHT-12 v4 Expression BeadChip
芯片信息:每张芯片可平行检测12个样本,含有共约48,000个基因转录本,信息来源除36,000个NCBI RefSeq外,还包含了从UniGene的12,000个转录本信息。

芯片名称:Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip
芯片信息:针对降解RNA,采用独特的探针设计技术,从石蜡包埋组织、福尔马林保存样本中获得部分降解的RNA进行全基因组水平基因表达研究。每张可平行检测12个样本,包含47231个基因转录本。

芯片名称:MouseWG-6 v2 Expression BeadChip
芯片信息:每张芯片可平行检测 6 个样本,包含有约 45,281 个来自 MEMBO-RefSeq 及其补充序列,RIKEN补充序列的转录本信息。

(2) microRNA转录组层次服务

    Affymetrix miRNA 芯片服务

Affymetrix公司于2011年2月底推出了miRNA芯片的升级版本GeneChip miRNA 2.0,这款芯片不仅完全覆盖Sanger miRBase 15.0版本131个物种的所有miRNA成熟体,还包括人的2,334个snoRNA和scaRNA,并针对人、大鼠、小鼠的miRNA前体设计了2,202个探针组。前代miRNA芯片产品将于2011年9月30日停止供应。该芯片仅需约3-5 μg的total RNA就可以出色的完成实验,同时保证了卓越的特异性,是研究miRNA全面而准确的芯片工具。
Affymetrix miRNA芯片检测,采用FlashTag Biotin RNA Labeling Kit进行样品标记过程,具有快速,精确,灵敏度高,重复性好的特点。RNA样品采用Poly(A) RNA聚合酶加尾,利用RNA连接酶将带有生物素标记的信号分子与之连接,连接产物和芯片进行杂交反应。可标记多种RNA样品:如total RNA;降解的RNA;低分子量RNA (LMW RNA)。整个标记过程可以在一个小时内完成。

芯片品牌:美国Affymetrix

芯片名称:Affymetrix miRNA 3.0 Arrary
信息信息:含盖Sanger miRBase V17.0数据库,同时检测153个物种的miRNA,同时检测成熟miRNA和miRNA前体,能检测人snoRNA和scaRNA。

   Agilent miRNA芯片服务

安捷伦科技有限公司(Agilent Technologies Inc.)作为国际领先的生物芯片制造企业,利用其先进的芯片生产工艺,开发出具有独特设计的miRNA检测芯片,能特异性地检测出成熟的miRNA并能很好地区分高度同源的miRNA 分子。该平台还具有特异性高、灵敏度高等特点。可以广泛地应用于检测和比较各类样品的miRNA表达状态,并通过分析其调控的靶基因来深入分析其调控机制或生物学功能。作为miRNA芯片的后起之秀,Agilent miRNA芯片自上市之初就受到业界广泛关注,上市两年来,其优异的性能指标更是获得科研工作者的广泛认可。

芯片品牌:美国Agilent

芯片名称:Agilent Human miRNA Array V19.0
芯片信息:芯片数据来源于Sanger miRBase release 19.0,覆盖2006个人类相关miRNA

芯片名称:Agilent Rat miRNA Arrary V19.0
芯片信息:芯片数据来源于Sanger miRBase release 19.0,覆盖719个大鼠相关miRNA。

芯片名称:Agilent Mouse miRNA Array V19.0
芯片信息:芯片数据来源于Sanger miRBase release 19.0,覆盖1247个小鼠相关miRNA

芯片名称:Agilent定制 miRNA Array V19.0
芯片信息:芯片数据来源于Sanger miRBase release 19.0,可以定制数据库包含的各个物种的相关miRNA。


3. 表观遗传学层次服务

DNA甲基化在基因表达调控中扮演着重要的角色(人类的甲基化只发生在CpG位点,大多数CpG 岛位于启动子和第一外显子区域,启动子区域的甲基化抑制基因的表达),在正常的细胞发育和维持组织稳定性方面有着重要的作用机制。人类的许多疾病(包括癌症)都是由于异常的甲基化引起的。应用芯片这个高通量手段检测基因组的甲基化,会大大加速甲基化研究发展,提升研究效率,并很有可能发展成人类疾病诊断、预防和治疗的有效工具,为此Illumina推出illumina DNA甲基化芯片。

(1)人DNA甲基化芯片
芯片名称:Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip

(2)定制甲基化芯片
芯片名称:Illumina custom methylationBeadChip

 
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